Bonsoir,

J'ai une demande pour faire tourner un logiciel de calcul intensif
(déconvolution d'image) de préférence sous un Linux.
quelqu'un a-t-il une expérience de Linux sur MacPro ?

Merci

Jean-Pierre

In article <1in38ps.5kzbmqffuphsN%jose.campos+spam***galacsys.c om>,
jose.campos+spam***galacsys.com (José Campos) wrote:

> J.P. Poindessault <jean.pierre.poindessault***univ-poitiers.fr> wrote:
>
> > Bonsoir,
>
> Bonjour,
> >
> > J'ai une demande pour faire tourner un logiciel de calcul intensif
> > (déconvolution d'image) de préférence sous un Linux.
> > quelqu'un a-t-il une expérience de Linux sur MacPro ?
>
> Certains l'ont, semble-t-il :
> <http://blogs.vmware.com/teamfusion/2008/09/vmware-fusion-h.html>

Pas grand rapport avec la choucroute. D'autant que vmware ne virtualise
que 2 cores sur les 8 d'un macpro.
Pour la haute performance on repassera !


patpro

--
A vendre ! http://www.patpro.net/blog/index.php/2008/01/12/133

In article <1in38ps.5kzbmqffuphsN%jose.campos+spam***galacsys.c om>,
jose.campos+spam***galacsys.com (José Campos) wrote:

> J.P. Poindessault <jean.pierre.poindessault***univ-poitiers.fr> wrote:
>
> > Bonsoir,
>
> Bonjour,
> >
> > J'ai une demande pour faire tourner un logiciel de calcul intensif
> > (déconvolution d'image) de préférence sous un Linux.
> > quelqu'un a-t-il une expérience de Linux sur MacPro ?
>
> Certains l'ont, semble-t-il :
> <http://blogs.vmware.com/teamfusion/2008/09/vmware-fusion-h.html>
>
> >
> > Merci
>
> De rien,

Ou, mais ça c'est un empilage OS X, fusion Linux qui ne doit pas être très
favorable au calcul intensif en 64bits.
J'ai déjà monté Ubuntu sur du Parallels, ça marche bien mais de là à faire cette
manip ...

Jean-Pierre

In article <1in3rgr.1hoehdbt7ia2N%pdorange***pas-de-pub-merci.mac.com>,
pdorange***pas-de-pub-merci.mac.com (Pierre-Alain Dorange) wrote:

> patpro ~ Patrick Proniewski <patpro***boleskine.patpro.net> wrote:
>
> > > > J'ai une demande pour faire tourner un logiciel de calcul intensif
> > > > (déconvolution d'image) de préférence sous un Linux.
> > > > quelqu'un a-t-il une expérience de Linux sur MacPro ?
> > >
> > > Certains l'ont, semble-t-il :
> > > <http://blogs.vmware.com/teamfusion/2008/09/vmware-fusion-h.html>
> >
> > Pas grand rapport avec la choucroute. D'autant que vmware ne virtualise
> > que 2 cores sur les 8 d'un macpro.
> > Pour la haute performance on repassera !
>
> C'est sur que le performances seront pas en rapport avec les
> possibilités de la machine. .........

Merci pour les liens.
Ce matin, je lis mon PCPro hedomadaire et trouve:
http://www.pcpro.co.uk/news/223587/u...jackalope.html

donc ça va venir mais pas avant le printemps ...

Jean-Pierre

In article <1in4lvd.1ctwe0l1jgl0lcN%patrick.1200RTcazaux***cadr atin.fr.invalid>,
patrick.1200RTcazaux***cadratin.fr.invalid (Tardigradus) wrote:

> J.P. Poindessault <jean.pierre.poindessault***univ-poitiers.fr> wrote:
>
> > (déconvolution d'image)
>
> C'est quoi, ce bestiau ?
Rien à voir avec le Mac, mais bon .... tu vas voir que tu es, comme tout un
chacun, un super "convolueur" ;-)))

Le calcul doit s'appliquer à des images de microscopie confocale.
Un microscope confocal est un instrument capable de faire la mise au point non
pas en surface mais à l'intérieur d'une couche épaisse de quelques microns.
Nous nous en servons pour examiner les structures internes de cellules en
culture (cellules souches et lignées résultantes).

Malgré la précision de l'instrument, comme tout instrument ou pour nous-mêmes,
ce qui est perçu ou enregistré est déformé par l'instrument ou le récepteur
lui-même. Le signal, l'information a été "convolué".
Exemple: déformations d'un objectif grand angle, spectre de notre système visuel
ou auditif, rendu d'une chaine HiFi, etc.
Le pire: Madame voit cette cravate turquoise, moi je la vois bleue ... où est la
vérité ??? ;-))

Le truc pour avoir une info aussi proche que possible de la réalité c'est
d'évaluer cette déformation avec un signal test.
On sait ce que l'on met à l'entrée, on devrait le retrouver à la sortie.
On "compare" ce que l'on devrait avoir et ce que l'on a =>fonction de transfert
ou de convolution.
Connaissant cette fonction, on calcule la fonction inverse et on l'applique aux
mesures ou observations et donc dans notre cas à nos images de microscopie
confocale: cette opération est la déconvolution.
Pour obtenir la valeur approchée la plus exacte possible en chaque point, le
calcul fait "glisser" la fonction de déconvolution sur tous les points
simultanément.
C'est un calcul qui est un bon candidat au parallélisme.
D'après les benchmarks du concepteur, le logiciel que nous souhaitons utiliser
(Huygens) est le plus efficace sur des double quad core Xeon avec 16Go de RAM,
sous un Linux 64 bit.

Jean-Pierre

P.S.: les premières applications pratiques de la déconvolution ont été
l'identification d'echos radar par des systèmes analogiques câblés. Les premiers
appareils de laboratoire ont été commercialisés dans les années 60/70.

In article
<jean.pierre.poindessault-715662.00192512092008***news.free.fr>,
"J.P. Poindessault" <jean.pierre.poindessault***univ-poitiers.fr> wrote:

> J'ai déjà monté Ubuntu sur du Parallels, ça marche bien mais de là à faire
> cette manip ...


as tu regardé sur <http://ubuntuforums.org/forumdisplay.php?f=211> ?

patpro

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http://patpro.net/blog/index.php/2008/01/12/133

In article <patpro-E7B1C5.06571312092008***news-1.proxad.net>,
patpro ~ patrick proniewski <patpro***boleskine.patpro.net> wrote:

> In article
> <jean.pierre.poindessault-715662.00192512092008***news.free.fr>,
> "J.P. Poindessault" <jean.pierre.poindessault***univ-poitiers.fr> wrote:
>
> > J'ai déjà monté Ubuntu sur du Parallels, ça marche bien mais de là à faire
> > cette manip ...
>
>
> as tu regardé sur <http://ubuntuforums.org/forumdisplay.php?f=211> ?
>
> patpro

non, j'y vais. Merci.

JP

In article <1in3rgr.1hoehdbt7ia2N%pdorange***pas-de-pub-merci.mac.com>,
pdorange***pas-de-pub-merci.mac.com (Pierre-Alain Dorange) wrote:

> <http://macprolinux.blogspot.com/>

Merci pour le lien.
Donc, on peut le faire, mais encore un peu geek comme manip !

Jean-Pierre